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【研发前沿】浅谈塞内卡病毒

2020-03-30 | 人围观

  原题目:【研发前沿】浅谈塞内卡病毒

  

  ?1、媒介

  2002年,研究人员判定出一种名为塞内卡病毒的新病毒,并被列为塞内卡病毒属中唯一的代表性病毒。尔后至2014岁尾,关于该病毒的风行病学、病发机制、病理、临床体征和诊断仍未取得任何停顿。塞内卡病毒病是由A型塞内卡病毒惹起的植物感染病,主要感染猪,对分歧年纪阶段的猪都易感。这类疾病后来被认为具有地区性,地区散布有限。北美研究人员或世界范围的研究团队并未遍及的研究该病,固然这是一种水疱性疾病,能够是因为感染频率低,唯一北美国家报导病例。

  在2015年关,巴西、泰国和中国首次爆发了由塞内卡病毒惹起的水疱性疾病。同年,研究发明病毒感染与更生仔猪逝世亡率相干。与此同时,美国也出现了异样的病例。这一系列病例的报导惹起了学者的存眷,因此,近期关于塞内卡病毒的研究愈来愈多。

  2、汗青分类和分子特点

  2002年,在美国马里兰州学者从PER.C6(人胚胎视网膜细胞)细胞系中偶然分别出塞内卡谷病毒。研究人员推测该病毒能够是经过应用受污染的胎牛血清或猪胰蛋白酶引入细胞培养物中。因为该病毒是在位于盖瑟斯堡(Seneca Creek State Park)左近的Neotropix公司的试验室平分其余,因此,被定名为Seneca Valley virus(SVV)。

  直到2014年,在NCBI数据库中唯一三个完整的塞内卡病毒病毒全基因组序列(GenBank登录号NC_011349,DQ641257,KC667560)。因此,很少有基于病毒基因组的研究,其原型毒株为SVV-001(GenBank登录号DQ641257)。经过构建种系发育树,明确了该病毒的分类学位置——属于小核糖核酸病毒科(Picornaviridae),与芥蒂毒属(Cardiovirus)的亲缘关系较近。2015年,国际病毒分类委员会(ICTV)将SVV改名为“A型塞内卡病毒(Senecavirus A,SVA)”,其地点的属定名为“塞内卡病毒属(Senecavirus)”。

  SVV-001具有宏大年夜RNA病毒基因组的典范特点,具有规范的L-4-3-4计划,即先导蛋白(L)、P1(裂解VP1、VP2、VP3和VP4四种结构蛋白)、P2(裂解成2A、2B和2C三种非结构蛋白)、P3(裂解成3A、3B、3C和3D四种非结构蛋白)。SVV基因组RNA由大年夜约7200个核苷酸(nt)构成,个中在5’UTR局部中有666 nt,在3’UTR局部中有71nt和poly(A)尾部。该病毒基因组唯一一个开放浏览框(open reading frames,ORF),编码约2180个氨基酸的多聚蛋白。

  

  图1 A型塞内卡病毒基因组结构

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